李伟英教授课题组        厚德载物 济水知源

基于高通量测序的水环境微生物生态宏基因组研究

基于高通量测序的水环境微生物生态宏基因组研究。实验室配备DellT7920,16核CPU(2.1ghz),32线程,96G内存工作站,并搭建了完整的宏基因组分析流程,可以对Illumina平台下机原始测序数据完成数据清洗、序列拼接、基因预测、物种和功能注释等任务。基于宏基因组进行管网水与生物膜中抗性基因水平传播机理、抗性基因与可移动遗传原件共存机制,以及环境因子如消毒剂、消毒副产物等对抗生素抗性的影响。此外,基于高通量测序大数据进行生物信息挖掘,利用机器学习等算法建模,从而进行微生物污染溯源等建模研究。

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